黑龙江地区设关始于1907年（清光绪三十三年），关址设在哈尔滨，史称滨江关，先后 由俄、英、意、法、丹、德、荷等国家人员任税务司（关长）。
　　　　哈尔滨建关后，通过监管、征税、缉私等方式，对江运、陆运、空运的进出口货物、行 李物品、邮递物品等各类货物、物品实行监督管理。1914年（民国3年）至1930年（民国16年 ），滨江关所辖各分关卡，主要监管中俄贸易、出口货物，按税则专章、专条规定征收关税 。关税制度不断变更，征稽关税曾发生三次大的起落。与此同时，各关口严禁走私，防止毒 品流入。
　　　　东北沦陷后，“滨江关”改为“哈尔滨税关”，其业务、政策、法令均由伪满洲国财政 部统管，从此，英、意、德、丹、荷等国在哈尔滨税关中的权利地位由日本人取而代之。日 本侵略者窃据东北海关大权，监管进出境商品，监管区域扩大，并修改了东北关税税率，实 行两种政策查缉走私。对老百姓从南方运进日用品视为“走私”严惩；而对借战争需要，通 过日本官方出具特许证明运出黄金、文物等视为“合法”，不予查缉处理。从1933年起，哈 尔滨税关关长由中国人担任。
　　　　黑龙江开放口岸设立海关机构，虽然促进了贸易往来和黑龙江地区的生产发展，但因海 关的管理权掌握在外国人手中，对外商外贸管理过宽，禁榷物资范围过大，对黑龙江地区经 济发展带来不利影响。
　　　　中华人民共和国成立后，人民掌握了海关自主权。1950年设立哈尔滨支关，受沈阳关和 东北海关管理局领导，依据国家法律、法规监管经此关进出的运输工具、货物、行李物品以 及其它物品，征稽关税，查缉走私，编制海关统计。1953年哈尔滨支关改建为哈尔滨分关， 仍受沈阳关和东北海关管理局领导。同年海关总署并入外贸部。1955年黑龙江省人民委员会 委托省外贸局领导哈尔滨分关。1958年，哈尔滨分关改建为独立关，称“中华人民共和国哈 尔滨关”，受对外贸易部海关管理局和黑龙江省对外贸易局双重领导。60年代初，在国民经 济困难、生活日用品紧张的情况下，走私活动再度兴起，哈尔滨海关严加查缉。1966至1978 年，哈尔滨关只监管来自朝鲜、日本、美国、新加坡、苏联、香港、澳门等国家和地区的邮 递物品，其它各项工作受“文化大革命”干扰不能政党进行，处于停顿状态。
　　　　1978年后，哈尔滨海关和各项业务迅速发展，监管进出口货物、行李物品及邮件，制止 走私违法，保证进出口货物正常出入境，维护国家的开放政策，方便国际交流和友好往来， 促进黑龙江省经济建设。
　　　　1980年2月，国务院正式决定改革海关管理体制，将全国海关建制收归中央，成立海关总 署，直属国务院，统一管理全国海关及其业务。哈尔关直接受海关总署领导，并受黑龙江省 人民政府监督指导。同年9月，哈尔滨关改称中华人民共和国哈尔滨海关。1984年6月，经国 务院批准，哈尔滨海关升格为局级海关，管辖绥芬河海关、黑河海关和同江海关。