黑龙江地区古代就有利用天然水道“刳木为舟，并木以渡”的记载。公元698～926年（ 唐朝渤海国时期），以木造船，并使用铁制部件。1421年（明永乐十九年），已能建造巨舡 （大船），供军队巡江使用。1685年（清康熙二十四年），曾动用建造的百余艘舰船，反击 和驱逐沙俄对雅克萨（今漠河东，呼玛西北的黑龙江沿岸一带）的军事侵略。
　　　　1918年，奉系军阀所属的东三省官银号成立广信公司船舶部。次年，改称哈尔滨戊通航 业股份有限公司，并开始在哈尔滨八区修建货栈码头，在圈儿河设立船坞机器厂，航运科技 随之发展。
　　　　1931年，日本帝国主义侵占东北后，为掠夺资源，于1937年起在哈尔滨、沙河子、佳木 斯等地修建直立式钢板桩码头，在黑河港修建直立式混凝土板桩码头。1938年在莲江口码头 安装了原煤装船运输机。
　　　　1949年中华人民共和国成立后，航运科学技术得到迅速发展。1959年，成立黑龙江航运 局水运规划科学研究室。1975年起，相继成立了黑龙江省航运管理局技术处（后改科技处） 、黑龙江水运科学研究所、黑龙江水运规划设计院、黑龙江省水运科技情报站，并确立总工 程师管理体制，管理研究航运科学技术，创办《北方水运》期刊，交流科技信息和生产情报 。到1985年，全省共有水运科技人员1291人，占职工总人数11%，其中有高级职称的5人，中 级职称159人。取得科研成果48项，获国家、省、部级奖励15项。科技部门与苏联、德国、日 本、加拿大等国开展科技交流活动，出国进行技术考察，合作开发，进修学习，请外国专家 来省作技术指导等。全省总计开通航道4228公里，设有电气化航标的3516公里，组建大型挖 泥船队7个；设计建造大马力的蒸汽机明轮船、大功率分节驳顶推船队、大功率柴油机；新建 扩建码头36个，共有各种装卸机械设备269台组，装卸船采用门吊、浮吊、联合装卸机，并向 集装箱、成组化发展；研究成功顶推运输法，船舶装有测深仪、雷达导航和无线电通讯设备 ，货船向大型化、客船向高速化发展。