中华人民共和国成立后，1949年12月至1953年，黑龙江地区境内的气象台站由东北军区 司令部气象处黑龙江省，松江省军事部气象科直接管理。
　　　　1953年8月1日，中国人民革命军事委员会主席毛泽东，政务院总理周恩来签发《关于各 级气象机构转移建制领导关系的决定》的命令，各地气象机构由军事系统建制转为政府系统 建制。1954年1月1日，黑龙江省、松江两省的气象部门划归农林水利局领导。
　　　　1954年7月21日，东北行政委员会第四次扩大会议通过《东北行政委员会关于贯彻中央人 民政府<关于撤消大行政区一级行政机构和合并若干省、市建制的决定>的实施方案》。同年8 月10日，原黑龙江省和松江省气象科合并办公，划归黑龙江省财政经济委员会领导，管理22 个气象台站。
　　　　1954年8月25日，成立气象处，隶属省财政经济委员会领导。
　　　　1955年2月22日，省人民委员会第一次会议决定设置黑龙江省气象局，归口农林办。
　　　　1958年，省人民委员会根据精简机构，体制下放精神，于5月21日决定将省气象局纳入省 水利厅，成立气象水文局(副厅级)，隶属省水利厅。
　　　　1958年8月～1962年5月30日，根据中央气象局关于气象台站管理体制下放精神，省气象 水文局负责业务管理，全省108个气象台站下放到当地专署、市、县人民委员会领导。
　　　　1961年2月1日，哈尔滨、齐齐哈尔、佳木斯民航气象台移交给省民航局；7月11日，镜泊 湖等10个专业气候站移交给有关部门；11月20日，省气象水文局发出通知，将在合江、牡丹 江农垦局所属农场中设立的国家气候站移交给所属农场领导；至年底，全省设在农场、林场 的气候站全部移交给农垦、劳改、林业部门。
　　　　根据国务院批准中央气象局的“集中领导、分级管理”原则，1962年5月30日，省人民委 员会(62)1040号文件批转省水利厅《关于调整气象水文台站管理体制的请示》，决定将气象 台站管理上收，其业务、干部、计划财务、统配物资、器材实行以省气象水文局管理为主， 党政、思想、职工生活等以地方政府管理为主的双重领导体制。
　　　　1963年12月9日，根据国务院的建议，省人民委员会决定成立黑龙江省气象局。水文业务 管理工作移交给省水利厅，1964年2月18日省气象局正式办公。
　　　　1968年8月，“文化大革命”期间，省气象局撤消。全省气象台站管理工作由省农业委员 会生产组负责，各地气象台站管理权下放到各级政府革命委员会，实行地方为主的管理体制。
　　　　1971年3月15日，根据国务院、中央军委(70)75号文件关于气象部门实行军队为主的双重领导 体制的决定，省革命委员会决定成立黑龙江省革命委员会气象局，全省气象部门实行省军区 和省革命委员会双重领导的体制，以省军区领导为主。
　　　　1973年3月6日，国务院、中央军委决定，中央气象局归国务院建制领导。7月，省革命委 员会决定，全省气象部门移交地方政府领导。
　　　　1980年，经国务院批准，对省以下气象部门实行以气象部门领导为主的管理体制。2月， 省政府黑政发(1980)59号文件决定，全省气象部门实行以省气象局和地方政府双重领导，以 省气象局为主的管理体制。8月18日，全省以气象部门为主领导的省、地区、市、县气象台站 实行局、台(站)合一管理。
　　　　1983年2月，根据国家气象局第二步体制改革精神，省级气象局收归国家气象局领导。至 此，全国气象部门的管理体制，确定为上级气象局和地方政府双重领导，以气象局领导为主 的管理体制。