1946年，黑龙江地区各省财政实行“自收自支，分散自给”时期，黑龙江省财政厅成立 了审计科。审计科长1人，（由会计科长兼任），科员4人。1947年10月，根据东北行政委员 会公布的关于省政府组织机构的安排，嫩江、合江、牡丹江、松江等省也先后在财政厅内设 审计科。配备科长1人，科员4人。随着解放战争的进展，国民经济的不断恢复，在财政上临 时性开支越来越多。中共松江省委于1948年5月1日决定成立财经委员会。委员会下设审计处 ，归省委会领导，专管临时性开支的审核。1948年，各省财政厅的审计任务越来越重，急需 增加编制。黑龙江省财政厅将审计科扩展为审计处。处下设审计、调统两科，编制为14人。 处长由财政厅副厅长张锦伦兼任。这一编制情况，于11月15日向东北行政委员会呈报。同年 ，松江省财政厅也将审计科改为审计处，同时增设了企业审计科，专管公营企业的会计审核 。任命王琪为审计处处长。1949年初，哈尔滨市财政局设立审计科。齐齐哈尔、牡丹江、佳 木斯等市财政局也都设立了审计股。
　　　　1949年3月，东北财政部在《东北地区财政收支预算决算暂行条例（草案）》中关于审计 体制作了规定：各级财政部门均需设审计机构或审计员专司审计业务。财政部为最终审计机 关，省（市）财政厅（局）及各财务单位为二级审计机关；县财政科及会计单位为初级审计 机关，分别接受同级政府及上级财政机关之领导，执行会计职权。此外，东北财政部制定的 《东北审计事务暂行规程》也规定：审计制度采取“三级制”，即县（包括所属机关）—省 （包括本位机关）—财政部。并以各级首长负责制为重心，以财政部审计室为最终审核机关 ，以财政经济委员会为最后决定机关。