一、黑龙江省都督府
　　　　1912年3月，黑龙江省设立都督府。原黑龙江巡抚宋小濂改任黑龙江省都督；原黑龙江行省公署，改组为黑龙江省都督府，仍驻齐齐哈尔。都督府是统一管理全省军政、民政事务的最高地方政权机关。
　　　　二、黑龙江省行政公署
　　　　1913年1月，黑龙江省行政公署正式成立。全国地方官厅组织“划一”，实行军、民分治的办法，并将府、厅、州一律改为县，统一实行中央政府统辖下的省、道、县三级政权体制。但因民政长仍由都督兼任，军、民大权依然集于一人之手，军民分治并未真正施行。
　　　　三、黑龙江省巡按使公署
　　　　1914年5月，中华民国北京政府颁布《省官制》，各省民政长一律改称巡按使，行政公署改称巡按使公署。与此同时，原省行政公署所设立总务处和内务、教育、实业各司均予裁撤，成立巡按公署政务厅；原设之国税厅筹备处及财政司亦予裁撤，成立省财政厅。
　　　　四、黑龙江省省长公署
　　　　1916年7月，黑龙江省省长公署正式成立，这是中华民国前期黑龙江省存在时间最长的政权机关。此后，奉军张作霖控制了东北。1918年9月7日，北京政府委张作霖兼东三省巡阅使，节制东北三省。黑龙江省省长公署逐渐形成4厅（政务、财政、教育、实业）、1处（警务）的组织系统，还附设有高等审判厅、高等检察厅，以及通志局、森林局、采金局、特派员交涉署、铁路交涉总局等机构。
　　　　五、黑龙江省政府
　　　　1928年12月东北“易帜”后，根据南京国民政府的指令，于1929年2月在各省裁撤道级行政机构，改行省、县二级制。至1930年，黑龙江省辖设42县、11设治局，当时属吉林省管辖的在今黑龙江省境内的尚有22县，合计64县、11设治局。中华民国时期奠定了黑龙江省设立县级行政建置的基础。
　　　　六、道尹公署与县公署
　　　　道是省与县之间的一级地方行政建制，其行政机关初为道衙门，不久改称观察使公署。1914年5月，将观察使公署改为道尹公署。
　　　　县是省以下始终存在而又最为重要的一级地方行政建制。中华民国之初，县的行政长官仍称知县，其官署称县衙门。1912年11月，各省暂行划一官吏名称，各府、厅、州、县行政长官改称知事。1913年1月又将府、厅、州改称县，行政长官改称县知事，行政机关改称县知事公署。1929年，将各县知事改为县长，县知事公署、设治局一律改为县政府。
　　　　七、黑龙江省议会
　　　　袁世凯攫取中华民国大总统之后，清末设立的黑龙江省咨议局于1912年4月7日取消，改组为黑龙江省临时议会。1913年3月21日，黑龙江省议会正式成立。1929年，省议会办公处改为国民党省党部。
　　　　八、东省特别区行政长官公署
　　　　中华民国初年，沙俄帝国主义在中东铁路及沿线“附属地”，非法设立了各种行政机构， 行使管辖之权。1922年11月，中国政府对中东路沿线11公里以内之区域划为东省特别区，设立东省特别行政长官。1923年3月1日，东省特别区行政长官公署于哈尔滨正式成立。