一、“条条”管理体制
　　　　1949～1952年4月，黑龙江地区国营医药商业企业很少，省级医药公司的机构设置、干部 任免、人员编制、计划编制与实施、业务活动、财务收支和会计核算等，由东北医药公司统 一管理；各市县医药公司（药店）的机构设置、干部任免、人员编制、计划编制与实施、业 务活动、财务收支和会计核算等由省级医药公司统一管理。地方党委、人民政府及其主管医 药的行政部门，只负责党务管理。
　　　　二、“条块”结合管理体制
　　　　1952年5月，黑龙江地区国营医药商业系统实行“条块”结合的管理体制。省级医药公司 的计划、业务、财务等经济工作由中国医药公司统一管理；各市县医药公司的计划、业务、 财务等经济工作由中国医药公司松江省公司、黑龙江省公司统一管理。省、市县医药公司的 干部任免、人员编制、行政监督和党务工作等由同级主管医药商业的行政部门管理。机构增 撤变更，省级医药公司由国家商业部批准；市县医药公司由省商业厅批准。
　　　　1953年9月，黑龙江地区执行国家商业部在《关于国营商业企业机构增撤变更批准权限的 意见》中的规定：“（1）省公司的增撤变更由商业部批准；（2）省直属批发站及省辖市的 市级商业机构的增撤变更，由大区商管局批准，报商业部备案；（3）上述两项以外的机构增 撤变更，由省商业厅征得省财委批准后，报大区商管局备案，并抄报给总公司。”东北区撤 销后，商业部于1955年8月，颁发了《国营商业企业机构增撤变更制度暂行办法（草案）》。 《办法》规定：省公司的增撤变更，由总公司或省商业厅提出，报商业部批准；医药二级站 的增撤变更，由总公司或省公司提出，经省商业厅审核同意后，报商业部批准；省辖市及专 区级机构的增撤变更，由省公司或省辖市、专区商业局提出，报省商业厅批准，并抄报商业 部；县级机构的增撤变更，由省公司或县商业科提出，经专区商业局同意，报省商业厅批准 ，并抄报商业部；省辖市的基层企业机构的增撤变更，由市公司提出，经市商业局审核同意 ，转报省商业厅批准；省、专区、市县公司的附属企业的增撤变更，均由省商业厅批准。全 省国营医药、药材商业企业贯彻执行这个《办法》。到1957年，全省多数市县建立了医药、 药材公司，暂时未设医药公司的县，根据省商业厅的统一部署，由县百货公司负责兼营医药 、药材批发零售业务。此时，省、市县医药、药材公司的计划、业务、财务等经济工作仍然 由上级公司统一管理。
　　　　1958年，根据国务院《关于改进商业管理体制的规定》要求，全省国营医药、药材商业 企业实行“块块”领导管理以后，由上级公司主管的计划、业务、财务和由“条块”共管的 机构增撤与变更等，改由同级商业行政部门管理；上级公司对下级公司，只保持业务指导关 系。交地方管理后，由于忽视了医药行业特点，影响了医药商业发展。1958年，全省有27个 市县医药公司，被当地商业行政部门撤销；1959年，又有3个县医药公司被撤销。全省医药批 发网点，由44个减少为14个；医药零售网点，由51个减少为8个；主要乡镇医药批发兼零售网 点，由19个减少为4个。
　　　　1962年5月，根据国务院《关于商业部系统恢复和建立各级专业公司的规定》要求，恢复 了由上级公司和当地商业行政部门“条块”结合的管理体制。被撤销的市县医药公司逐步恢 复，没有医药公司的市县，陆续建立了医药公司。
　　　　1966年，“文化大革命”期间，全省医药商业实行多年的“条块”结合的管理体制被废 除。全省各级医药、药材商业机构，有的被撤销，有的被合并，造成混乱。
　　　　1979年，在省医药管理局统一领导下，恢复了“条块”结合管理体制。
　　　　三、“块块”管理体制
　　　　1984年以后，除哈尔滨、齐齐哈尔、牡丹江、佳木斯市外，多数市县医药、药材公司被 撤销，组建医药药材公司或医药管理局；省医药公司由管理型向经营型转变；各市县药材系 统由市县医药药材公司或医药管理局取代。省医药总公司直接管理直属企业，市县级医药、 药材机构，由市县管理。