伊斯兰教信奉者在唐代就有进入我国定居的。金末元初，由于大批色目人通过战争征发 或者派遣、经商等途径进入中国，他们大多为穆斯林。其中许多人为今天回族的前身，大约 此时伊斯兰教信奉者即有进入黑龙江地区的。
　　　　伊斯兰教的古代遗迹，在黑龙江地区已难寻觅迄今尚未发现清以前的伊斯兰教文物遗存 。
　　　　清代，迁徙到黑龙江境内的穆斯林前后经历了清初的开禁、中期的封禁和后期的开禁放 垦3个阶段。移入黑龙江的人员主要有2种类型，即“流人”、垦民和流民。
　　　　一、穆斯林“流入”
　　　　清代黑龙江地处中国边陲，人烟稀少，交通不便，经济落后。自清朝顺治中期始，便成 了接纳谪戍“流入”（即“罪犯”）流放之地。顺治年间，“流入”多发遣宁古塔（今海林 县旧街乡），其中有少数穆斯林。1658年（清顺治十五年），穆斯林王某等人，因贿赂内监 吴良辅“鞠讯得实……俱姑免死，各责四十板，并父母兄弟妻子，流徙宁古塔，家产籍没。 ①（①李兴盛、张杰《清实录黑龙江史料摘钞》116页，1983年。）便是一例。
　　　　西北地区的穆斯林由于不堪清王朝的民族压迫，在伊斯兰教的旗帜下，曾多次掀起反清 风暴。起义被镇压后，参加起义的穆斯林多被流放到卜奎（今齐齐哈尔市）等地沦为旗人的 奴隶。1781年（清乾隆四十六年），苏四十三为了争取哲赫林耶派的生存和发展，举行反清 起义。失败后，有12户穆斯林被流放卜奎。1789年（清乾隆五十四年）六月，将“查出形迹 可疑之回民马有成等二十四名，请将该犯等佥同家属，……已谕令军机大臣等，于核议时改 发黑龙江等处，给索伦为奴，自较为妥协。”② （②同上，589页。）1792年八月（清乾隆 五十七年八月）。“据琅玕奏，内地回民李子重等十八人，私随叶尔羌回人迈玛第敏，学习 经卷，审拟具奏等语。内地回人潜往新疆私习经卷，实属不法，……著发往黑龙江，给索伦 、达呼尔为奴。”③（③同上，608页。）1794年（清乾隆五十九年）七月，“刑部议覆：陕 甘总督勒保奏称，纠众诵经回犯马恒、马源等10名，请发往黑龙江，给索伦等为奴。得旨： 此等犯人发往索伦等自不入教，该处回民甚多，难保无煽惑情事，著交明亮等严行管束，倘 有引诱回众人教之事，即行审明正法，以示惩儆。”④（④同上，632页。）中国伊斯兰教哲 赫林耶第三世教主马达天等数十人被流谪卜奎。途经船厂（今吉林市）时，马达天于1817年 10月16日（清嘉庆二十二年九月初六日）病逝，终年60岁。其余教下皆流谪卜奎。马达天病 逝后，由穆斯林李某将马安葬在自家祖坟地，遂修拱北于吉林。此后，每逢马达天忌日，来 自新疆、宁夏、青海、云南、河北、河南、黑龙江等省区的穆斯林到此祭祀马达天。1826年 （清道光六年），又有新疆维吾尔族穆斯林40多人被流放黑龙江地区，途中病故和被官兵杖 亡者过半。到达今龙江县境内者仅18人。
　　　　二、穆斯林流民 　　1668年（清康熙七年），清廷下令废除《辽东招民开垦例》，对东北实行封禁。取缔移 民政策虽三令五申，但仍挡不住为求生存而来东北的流民，在封禁期间，仍有相当一批穆斯 林人口流入黑龙江地区。他们长途跋涉，冲破封禁，来此垦荒。始则为佣工，远出投身服役 ，继而渐向旗人佃种田亩。1760年（清乾隆二十五年）黑龙江将军绰勒多为疏散回族穆斯林 而奏请朝廷，从这些流民中派遣回民百名，“前往呼伦贝尔，教导灌田”①（①李兴盛、张 杰《清实录黑龙江史料摘钞》，465页。）。清政府为进一步禁止流民潜入，1776年（清乾隆 四十一年）十二月重申，全面封禁吉林地方，谕令吉林将军傅森：“永远禁止流民，毋许入 境”。②（②同上，530页）嘉庆年后，由于迁徙的人口增长，而形成诸多村落，村落中贸易 逐渐繁盛。自清代中期起，穆斯林因生活习惯和宗教生活的需要，从散居状态逐渐向村落聚 拢。回族穆斯林除多数人从事农业生产外，还有以商业、手工业谋生者，流入城镇定居后， 便筹款建清真寺、购买墓地。这些回族穆斯林定居后，逐渐编入民籍，成为黑龙江人民的一 部分。
　　　　三、清代招垦 　　朝廷为医治战争创伤，安定社会，恢复东北农业生产和开发地方经济，于1653年（清顺 治十年）颁布《辽东招民开垦例》。在北方省区“悬赏招民”，并下令地方官吏，“招徕流 民，不论籍别，使开垦荒田，永准为业”。其后山东、河北一带民众来到黑龙江，其中有少 数回族穆斯林，到三姓（今依兰县）、卜奎，人旗当差。不久即实行封禁政策。卜奎穆斯林 由于来者日众，于1684年（清康熙二十三年）集资建民房式清真寺，同时以70吊钱价额，购 买城南门外（今龙沙公园）一段空地为墓地。自1861年（清咸丰十一年）后，黑龙江部分地 区开禁。回族穆斯林也随之迁入。如，最早到绥化者为山东的沙全仁及其胞弟；继有河北、 吉林等地回族穆斯林亦相继来此，并于1877年（清光绪三年）建清真寺。1904年（清光绪三 十年）后，黑龙江全境开禁，加之中东铁路通车，铁路沿线城镇逐渐繁荣。当时，扬州，镇 江、山东、河北、辽宁等地的一大批回族穆斯林投亲靠友来此谋生，多集中在铁路沿线的大 小城镇，或其他交通便利的城乡。村落中的穆斯林因没有土地，也从村落中流入城镇谋生。 因此，从事农业生产的穆斯林甚少。多数人转为从事牛羊行业或其他手工业，以及经营民族 风味小吃和出卖劳动力，间有少数资本雄厚者经营较大店铺。如曾在北京经营饭店的20多名 回族穆斯林集资3000多银元，移居卜奎继续经营饮食业。据《黑龙江志略》记载，清末黑龙 江省信奉伊斯兰教者共14786人。