1945年8月，苏联红军进兵哈尔滨时，立刻逮捕了市内东仪天主教哈尔滨主教府堂主教祁 高德，以其搞特务活动之故，该堂被查封，宗教活动停止。齐齐哈尔教区以主教胡干普为首 多名外国传教士，与美帝国主义和国民党组织勾结，密设电台，搜集解放军和人民政府情报 、藏匿手枪、子弹，资助匪特，进行间谍活动。外籍神父在齐齐哈尔组织“党务复兴会”等 等，外国传教士扬言：“共产党要消灭天主教”、“天主教与共产党势不两立”。
　　　　1946～1947年，黑龙江地区开展土地改革运动，东北民主联军七师进驻绥化，临时借用 绥化天主堂的神父宿舍，政委樊雨香对本堂中国神父王瑞寰说：“共产党的政策是宗教信仰 自由，别害怕，该念经念经，该传教传教，我们不妨碍你们”。土改开始时，农会占了望奎 县天主堂。樊政委给望奎县驻军写信，天主堂被腾了出来。宗教活动照常进行，樊政委在天 主堂王神父的房门上贴了一张亲自题写的“宗教开明人士”。有些外国神职人员，却煽动教 徒攻击土改运动和解放战争。如齐齐哈尔教区胡干普主教于1946年向教徒发出第十号通令， 反对人民政府的土改政策，说农民分地分粮斗争地主是“暴虐行为”，“得受报应”，煽动 翻身的农民教徒给地主退回斗争果实，不准其参加群众斗争和参军。天主教会中的帝国主义 势力，在风起云涌的农民运动面前受挫，宗教活动也暂时随之停止。县镇乡的一些天主教堂 的房产也就被农民（包括教徒）及其它部门所占用，打击了外国神职人员利用天主教及其活 动场所进行反对人民政府和革命风暴的行径。黑龙江地区一些大城市的天主教情况因不涉及 土改运动，宗教活动照常进行，但是对中国共产党及其领导的中国人民的解放事业和革命活 动，一部分外国传教士也持有不同程度的反对态度，远离了宗教信仰。
　　　　1949年7月1日，梵蒂冈驻国民党政府公使黎培里代表罗马教廷向全中国各省市教区发布 函令，令各教区主教通过神父用口头方式向教徒传达：所有教徒不许参加共产党及其一切组 织、不许阅读共产党出版的书报，不看共产党的电影，不听共产党的广播。否则就给教徒加 罪并恫吓说“灵魂要下地狱”，或开除教籍。中国籍神长教友中开始觉悟到这是政治问题， 而不是信仰问题。但是，在外国传教士中，却有少数的帝国主义分子仍在按教廷的函令办事 ，个别的甚至进行间谍活动。
　　　　1950年，在齐齐哈尔教区内以教区主教胡干普为首的反革命集团间谍案被人民政府破获 并公诸于报端后，哈尔滨和齐齐哈尔两地天主教会内，又出现反动的“圣母军”支会，暗地 宣扬“作殊死的斗争”、“以推翻它为基础，在它的残碑断碣里树立起基督神国的旗帜”。 1951年3月东北人民政府将胡干普等外籍反革命分子驱逐出境。同年，人民政府明令取缔哈尔 滨和齐齐哈尔的天主教反动秘密组织圣母军，帝国主义分子吴博满、孔士舟①（①黑龙江省 档案馆藏档案全宗第159号。）被依法驱逐出境。哈尔滨天主堂神父金善永（朝鲜族）反革命 间谍案犯被政府缉捕法办。自1950年始，天主教界爱国人士在哈尔滨发起天主教反帝爱国运 动，成立了天主教友爱国会。在人民政府支持下，天主教中反革命分子被清除后，至1954年 ，省内的外国主教、神父、修士、修女已全部陆续自动离境，天主教反帝爱国运动蔓及全省 ，1959年召开全省天主教徒代表大会。会议一致决定天主教与梵蒂冈和有关外国修会彻底割 断政治、经济和组织关系，走反帝爱国，独立自主，自办教会的道路，会议期间，成立了黑 龙江省天主教爱国会。一致决定撤消省内几个外国传教区，统一成立中国天主教哈尔滨教区 （1983年改称中国天主教黑龙江教区）自选自圣中国神父为本教区主教。从此，黑龙江省天 主教同全国一样，彻底摆脱了外国宗教势力的控制与支配，走上了中国的神职人员和教徒自 办教会的爱国爱教道路，恢复正常的宗教活动。
　　　　“文化大革命”时期，江青、林彪反革命集团破坏了党和国家的宗教信仰自由政策。在 这场灾难中，省内各地的天主教堂受到不同程度的损坏，正常宗教活动悉被停止。
　　　　中共十一届三中全会后，党和国家重申宗教信仰自由政策，省、市等各级政府恢复宗教 工作机构，平反宗教界中的冤假错案，并改正“反右”时期宗教界中被错划的右派，对宗教 界人士落实政策，恢复爱国团体，并建立省天主教教务机构。神职人员和广大教徒在党和国 家的宗教政策保障之下，充分享有宗教信仰自由的权利。根据实际情况，不仅恢复和新建了 一些天主教活动场所，同时与辽、吉两省天主教组织联合创办了沈阳天主教神学院，以解决 神职人员后继乏人问题。为实现教会自养，宗教房产政策得到逐步落实。天主教徒爱国主义 觉悟不断提高，坚持独立自主、自办教会方针，在社会主义两个文明建设中，涌现出不少先 进生产（工作）者、五好家庭和文明村。有的当选为省内各级人大代表或政协委员。截至19 85年统计，黑龙江省已恢复天主堂3处，公所和家庭活动点28处；有主教1名、神父9名、神修 生8名，修女近20名，全省教徒约有3．5人。