中华人民共和国卫生检疫局（以下简称国家卫检局）在黑龙江省境内设哈尔滨、黑河、绥芬河、东宁和同江等5个直属卫生检疫局，各直属局设在本省各口岸的分支机构负责本辖区的入出境卫生检疫工作。依照《中华人民共和国国境卫生检疫法》、《食品卫生法》、《国际卫生条例》等规定，对入、出境的人员、交通工具和集装箱，以及可能传播检疫传染病的行李、货物、邮包等，实施卫生检疫、疾病监测、卫生监督、卫生处理；对入、出境的微生物、生物制品、人体组织、血液及其制品以及能传播人类传染病的动物，实施卫生检疫；对进口食品实施卫生监督检验，办理入、出境卫生检疫和卫生证书。
    5个直属局在全省各口岸共设13个分支机构、5个办事处。黑河卫生检疫局下设：漠河、逊克、嘉荫、孙吴等4个卫生检疫局和齐齐哈尔卫生检疫局筹备处。哈尔滨卫生检疫局设：佳木斯（代桦川）、萝北、饶河、哈尔滨机场和哈尔滨港5个卫生检疫局和驻哈尔滨经济技术开发区办事处。绥芬河卫生检疫局设：密山、虎林2个卫生检疫局和牡丹江办事处、铁路办事处、公路办事处。同江卫生检疫局设：抚远、富锦2个卫生检疫局和三个口岸过货点（即东港、乌苏镇、绥滨）。另设东宁卫生检疫局。
    全省卫生检疫系统现有职工229人，各类专业技术人员占职工总数的80.3％，为增强卫生检疫执法素质，提高监测检验能力，各直属局均建立有标准实验室，配备有较先进的和常规的各类仪器设备与检验器材以满足口岸卫生检疫的需要。（刘仲玉）